Для начала проще и удобнее по клеточкам - особенно в младшей школе. Еще ведь и линейку бывает нелегко удержать ровно, линию провести...
Но если дело уже касается более точных построений - с точностью до мм, например, то по линейке, конечно. Хотя и линейки бывают с некоторой погрешностью... Так что всё более-менее условно.
А еще у учительницы хорошо бы спросить - какие лично у нее требования и мысли на этот счет.