По-моему, это связано с пресловутой ф-63 (прививочной формой). Т.е., даже если вы все прививки делали в частной клинике и они вписаны в сертификат, они еще должны быть "учтены" в гос.учреждении.
Или я ошибаюсь?
Других причин для отправки в поликлинику не вижу. Может быть, еще какая-нибудь пометка о том, что медкарта к школе сделана?
Все будет хорошо и поменьше нервов! Пусть малыш растет спокойно

.